GHOR Haaglanden bestaat uit twee onderdelen: de bureau organisatie en de operationele organisatie. De Regionaal Geneeskundig Commandant (RGC), Ton van Dijk, geeft leiding aan GHOR Haaglanden.

De bureau organisatie
De bureau organisatie van de GHOR Haaglanden houdt zich vooral bezig met de (beleidsmatige) voorbereiding op rampen en grootschalige ongevallen. Denk bijvoorbeeld aan het opstellen van draaiboeken ter voorbereiding op mogelijke rampen als bedreiging van de volksgezondheid (influenzapandemie) en het adviseren van gemeenten bij grote bouwprojecten. Maar denk ook aan evenementenadvisering en het opleiden, trainen en oefenen van de GHOR functionarissen in samenwerking met de zorgketen. Het bureau vervult een netwerkfunctie voor alle zorgorganisaties  in de regio Haaglanden. Het GHOR bureau verbindt deze organisaties en bevordert zo de samenwerking (en dus de hulpverlening) tijdens rampen en grootschalige ongevallen. 

De operationele organisatie
De operationele organisatie bestaat uit GHOR functionarissen die ten tijde van een ramp of grootschalig ongeval de coördinatie en leiding hebben over de geneeskundige hulpverlening. De RGC geeft, als eindverantwoordelijke, leiding aan de operationele organisatie. Zorginstellingen en zorgverleners blijven zelf te allen tijde inhoudelijk verantwoordelijk voor de door hen geleverde zorg.